宏基因组与代谢组/脂质组学R软件数据可视化11月26日培训班
时间:2022-11-26 09:00 至 2022-11-26 18:00
地点:线上活动
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宏基因组与代谢组/脂质组学R软件数据可视化11月26日培训班 已过期会议时间:2022-11-26 09:00至 2022-11-26 18:00结束 会议地点: 线上活动 详细地址会前通知 会议规模:暂无 主办单位: 上海循掘生物科技中心
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会议介绍
会议内容 主办方介绍
宏基因组与代谢组/脂质组学R软件数据可视化11月26日培训班宣传图
宏基因组与代谢组/脂质组学R软件数据可视化
研讨会
2022年11月26日 腾讯会议网络会议室
【背景介绍】
微生物是自然界中分布最广、种类最多、数量最大的生物类群。以肠道微生物为例,人体内微生物的总数量约是人体细胞总数的10倍 —— 越来越多的研究发现,肠道微生物与人体健康有着密切的关系,而微生物产生的代谢物是调控过程中最主要的中间递质之一。
宏基因组研究包括16s测序和宏基因组测序,可以获得微生物群落丰度以及组成。通过分析可以获得关键菌群以及功能,为疾病治疗提供研究基础。
代谢组学和脂质组学是基于LC-MS液质联用技术对生物样本中的小分子代谢物/脂质分子进行定性和相对定量分析。严格来讲,脂质组也是代谢组的一种。
宏基因组-代谢组/脂质组的联合分析能够从多个维度阐释一个科学问题,可以用来解释差异菌群与差异代谢物的关联性,从而帮助建立微生物-代谢物-表型之间的逻辑关系。
基于以上原因,医药加推出“宏基因组+代谢组/脂质组联合分析”R软件实操课程,带您充分挖掘数据,掌握生信高级分析能力。
【主要内容】详细内容见下文日程表
- 宏基因组生信文章解读与报告解读;
- R和Rstudio软件安装,宏基因组与代谢组/脂质组学联合分析实操;
- 生信SCI文章实用数据处理与图片导出。
【会议预期】
通过一天的时间学习数据处理分析及可视化作图,得到SCI水平的图片。
【讲师简介】
宋伟博士
成果:参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。
研究方向:有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。
培训经历:在上海、北京、广州、沈阳、南京等城市举办过几十场现场培训班。
【会议日程】
宏基因组与代谢组学R语言分析及可视化会议日程 | |||
时间安排 | 课程表 | 介绍 | |
上午 | 9:00 -10:15 | 生信分析思路及测序标准报告解读 |
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10:30-12:00 | R语言基础 |
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下午 | 13:30 -15:15 | 宏基因组及代谢组数据生信分析R实操演示 |
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15:30 - 17:15 | 数据库及在线工具实操 |
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17:15- 17:30 | 答疑 | ||
示例图展示:
示例图 箱线图
示例图 PCoA图
示例图 物种组成柱状图
示例图 热图
示例图 venn图
示例图 circos环状图
示例图 PCA分析
示例图 桑基图
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上海循掘生物科技中心于2020年2月21日举办TCGA&GEO生信高通量数据挖掘分析研讨会2020(2月深圳班)会议。
会议日程
会议嘉宾
参会指南
会议门票
主办方:上海循掘生物科技中心
会议时间:2022年11月26日
会议地点:线上:腾讯会议网络会议室
收费标准:会务费:线上:1500元/人;
优惠政策:
1.提前确认报名及转账的,可以提前拿到学习材料
2.三人组团报名,每人优惠100元
3.四人组团报名,每人优惠200元,
4.六人组团报名缴费,可免1人会务费!
可以开正规会务发票,纸质邀请函(盖红章)。
注意事项:必须携带win10以上系统的电脑,现场不得录音录像。上课软件为R和Rstudio。
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温馨提示
酒店与住宿:
为防止极端情况下活动延期或取消,建议“异地客户”与活动家客服确认参会信息后,再安排出行与住宿。
退款规则:
活动各项资源需提前采购,购票后不支持退款,可以换人参加。
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