宏基因组与代谢组学R语言分析及可视化实操研讨会8月班已过期
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会议时间：2022-08-27 09:00至 2022-08-27 18:00结束

会议地点：线上活动详细地址会前通知

会议规模：暂无

主办单位：上海循掘生物科技中心

发票类型：增值税普通发票增值税专用发票

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会议介绍
会议内容主办方介绍

宏基因组与代谢组学R语言分析及可视化实操研讨会8月班宣传图

宏基因组与代谢组学 R语言分析及可视化实操研讨会

2022年8月27日腾讯会议网络会议室

【背景介绍】

微生物是自然界中分布最广、种类最多、数量最大的生物类群。以肠道微生物为例，人体内微生物的总数量约是人体细胞总数的10倍 —— 越来越多的研究发现，肠道微生物与人体健康有着密切的关系，而微生物产生的代谢物是调控过程中最主要的中间递质之一。
宏基因组研究包括16s测序和宏基因组测序，可以获得微生物群落丰度以及组成。通过分析可以获得关键菌群以及功能，为疾病治疗提供研究基础。

代谢组学是基于LC-MS/MS液质联用技术对生物样本中的小分子代谢物进行定性和相对定量分析。

宏基因组-代谢组的联合分析能够从多个维度阐释一个科学问题，可以用来解释差异菌群与差异代谢物的关联性，从而帮助建立微生物-代谢物-表型之间的逻辑关系。

基于以上原因，医药加推出“宏基因组+代谢组联合分析”R软件实操课程，带您充分挖掘数据，掌握生信高级分析能力。

【主要内容】详细内容见下文日程表

宏基因组生信文章解读与报告解读；
R和Rstudio软件安装，宏基因组与代谢组学联合分析实操；
生信SCI文章实用数据处理与图片导出。

【会议预期】

通过一天的时间学习数据处理分析及可视化作图，得到SCI水平的图片。

【讲师简介】

宋伟博士

成果：参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请；肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建；完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。

研究方向：有近十年的生信分析经验，擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等，精通perl、R等编程语言。

培训经历：在上海、北京、广州、沈阳、南京等城市举办过几十场现场培训班。

主办方：上海循掘生物科技中心

会议时间：2022年8月27日

会议地点：线上：腾讯会议网络会议室

注意事项：必须携带win10以上系统的电脑，现场不得录音录像。上课软件为R和Rstudio。

【会议日程】

宏基因组与代谢组学R语言分析及可视化会议日程
时间安排		课程表	介绍
上午	9:00 -10:15	生信分析思路及测序标准报告解读	生信简介；宏基因组生信文献解读；宏基因组与其他组学整合文献解读； 16s测序分析报告解读；宏基因组测序分析报告解读；代谢组分析报告解读；
上午	10:30-12:00	R语言基础	R软件与Rstudio软件安装； R基础—类与对象（元素、向量、矩阵）； R基础—函数； R基础—路径修改、文件导入、导出图表； R基础—R包及安装

下午	13:30 -15:15	宏基因组及代谢组数据生信分析R实操演示	α多样性箱线图； β多样性PCoA分析；物种组成柱状图；物种热图分析 LeFse分析树形图分析。无监督PCA分析； PLS/DA分析 Limma差异分析计算logFC与p值；火山图与差异基因热图；功能气泡图； 16s与代谢组整合共表达分析；桑基图分析。
	15:30 - 17:15	数据库及在线工具实操	Venn图在线工具； KEGG 数据库； metaboAnalyst数据库；
	17:15- 17:30	答疑