第十九期中药网络药理学研究技术专题会议

2021/10/23-24  网络精讲班  

课程简介

    近年来国际上倾向于用多靶点药物治疗复杂疾病，中药复方因其多成分、多靶点的特点在国际医学界及药物发现领域获得了较高的关注,成为中药现代化的重要机遇。国家在中药研究方面也有很大力度的投入和支持，中药复方的研究已成为近年来研究的热点和国家自然基金重点扶持的领域。然而，由多种天然产物配伍而成的中药复方，存在成分复杂、靶点和机制不清的问题，其研究难度很大，尤其是在SCI论文发表过程中难以获得认可。

将网络药理学应用于中药复方研究，打破了传统的中药复方机制研究的瓶颈，使得原先难以定性的机制得以预测和验证。作为临床医生、科研人员和硕博士研究生，尤其是没有生物信息学分析基础和网络药理学基础的初学者，面对自己实验获得的大量错综复杂的基因组学、蛋白质组学数据时，难免会无从下手分析。不知道如何去解析一个中药复方的作用机制，如何去挖掘成分-靶点之间的关系，如何将药物作用机制和疾病机制相关联？如何利用免费的数据挖掘，为自己的中药复方研究增添亮点？如何利用生物信息学技术，解析中药复方作用机制？

     本次学习班将邀请长期从事网络药理学研究的专业人士,结合个人实践经验, 带领广大学员，共同学习将网络药理学的研究方法用于中药复方研究。讲课内容涉及网络药理学的数据获取、分析方法、论文撰写、项目设计、基金申请等方面。现场实战教学，带领学员解析中药复方作用机制，学员也可以将自己的实验数据带来学习班，利用课间时间进行分析。

课程内容、目标与特色

     本次学习班课程将以最简单易懂的方式介绍复杂疾病和中药复方研究所用到的网络生物学的数据、方法和技术，并以中药复方解析的工作流程为线索，讲授如何一步一步地研究复杂疾病和挖掘中药复方的作用机制。本学习班全部采用免费数据库和在线分析工具，学员不需要编写程序。

本次学习班全程电脑实战教学，90%以上为上机指导操作，无繁琐的理论授课，做到课程学完，就能独立分析复杂疾病、解析中药复方。老师将长期在学习群解答学员问题。

课程内容、目标与特色

本次学习班课程将以最简单易懂的方式介绍复杂疾病和中药复方研究所用到的网络生物学的数据、方法和技术，并以中药复方解析的工作流程为线索，讲授如何一步一步地研究复杂疾病和挖掘中药复方的作用机制。本学习班全部采用免费数据库和在线分析工具，学员不需要编写程序。

本次学习班全程电脑实战教学，90%以上为上机指导操作，无繁琐的理论授课，做到课程学完，就能独立分析复杂疾病、解析中药复方。老师将长期在学习群解答学员问题。

主讲老师

   本次主讲老师是生物信息学博士毕业,从事网络药理学研究多年,主持、参与了多项国家自然基金项目，发表数十篇SCI论文，含多篇5分以上的文章，获得多项省部级科研及教学奖项。讲课效果好，学员评价高。

适合对象

   各级医院临床医生、药师、科研单位研究人员、高校硕/博士研究生、对利用网络药理学研究复杂疾病、药物机制及中药复方感兴趣的广大师生（尤其适合初学者和无基础的学员，无需任何基础，也无需学习任何编程语言，轻松分析复杂疾病和中药复方）。

课程设置：

第一天：网络药理学基础知识、数据来源和实用技能

（一）网络药理学基础知识

1.  网络药理学的发展历程和研究思路

2.  分析网络药理学SCI论文3篇，解析数据分析要点和论文写作模式

（二）网络药理学数据获取

   1. 中药有效成分以及对应靶点的查找和获取、对比药物及其靶点的获取（上机实践）。介绍分子对接方法、化学相似性方法以及数据库查询方法获取中药有效成分的靶点；介绍PubChem, STITCH,DrugBank等数据库的使用方法。主要内容：

（1）  常用中药数据库及使用方法：如何从数据库获取中药有效成分，如何进行ADME筛选，如何获取化合物的靶标？

（2）  西药数据库及使用方法：如何获取某种疾病的西药和对应靶标？

（3）  蛋白质信息数据库及使用方法：如何进行靶蛋白的名称、ID转换？

（4）  化合物信息数据库及使用方法：如何获取中药小分子的结构、靶标？

（5）  用化学相似性预测化合物靶点

（6）  基于药效团模型的药靶预测

（7）     用AutoDock作分子对接验证化合物的靶点

2.  查找和获取中药所治疗疾病的相关基因（上机实践）。以Alzheimer's disease 为例，介绍如何在OMIM, DisGeNet，Genecards查询与疾病相关的基因。

3. GEO数据库中疾病相关基因芯片数据的获取和分析（上机实践）

（三）网络药理学的数据分析（上机实践）

1. 靶点富集分析：DAVID、Metascape等工具的使用方法及结果解析,代谢组学结果的通路富集分析

2. 基于基因表达谱数据用CMAP分析药物作用机制

第二天：网络药理学实用技能、研究案例、基金申请

（一）网络构建、分析、美化:Cytoscape软件的详细讲解（上机实践）

1. 靶标网络、疾病网络构建和分析

2. 药物-靶标相互作用网络构建和分析

3. 药物-靶标-通路网络的构建和分析

4. 代谢物网络的构建与分析

5. 网络拓扑特征的计算；网络拓扑指标的含义；重要节点识别；模块分解；网络可视化和美化；Cytoscape插件的安装和使用等

（二）网络药理学常用图形绘制

维恩图、通路富集图等的绘制

（三）网络药理学研究案例

详细解读若干篇SCI论文和博士论文的研究思路和研究方法

一步一步地带领大家分析一个复方

（四）网络网络药理学的基金申请和项目设计

备注：自带笔记本电脑，安装WINDOWS 7.0操作系统及Office Excel 2010等软件。

以下为会务信息：

时间地点：第十九期 2021/10/23-24  网络精讲班

注册费用：3200元/人，注册费包含网络直播平台费、专家讲课费及视频课程的费用。