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挖掘单细胞测序公共数据库来发表文章 5月线上班
时间：2021-05-29 09:00 至 2021-05-30 18:00
地点：线上活动
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挖掘单细胞测序公共数据库来发表文章 5月线上班 已过期会议时间：2021-05-29 09:00至 2021-05-30 18:00结束 会议地点： 线上活动 详细地址会前通知 会议规模：20人 主办单位： 玮瑜科研平台（上海玮瑜生物科技有限公司）
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会议通知
会议内容 主办方介绍
挖掘单细胞测序公共数据库来发表文章 5月线上班宣传图
发nature、nature cell biology杂志10多篇文章的老师教您学会挖掘单细胞测序公共数据库来发表文章
2021年5月29-30日 （周末线上授课 非视频播放 互动性强）
更好的服务，老师在群里长期答疑
报名缴费成功后可以先预习往期录制的视频
同时赠送现场录制的视频
【课程背景】
单细胞测序技术作为科研领域最新、最热的技术,发展神速。好的技术给科研带来了更为丰富、精准的数据。如何在最终的数据分析中结合生物学背景挖掘到更多信息也是困扰很多科研人员的一大难题。为了让更多的研究者了解单细胞测序数据挖掘的常用套路以及单细胞常用数据分析软件的使用特举办单细胞测序数据挖掘与课题设计学习班。
从2015-2019年度单细胞项目中标数量和中标金额来分析，整体呈指数增长的态势。中标数量从2018的45项，增长到2019的113项；中标金额从2018的2045.50万元，增长到2019的6608.79万元。
【学习目标】
1、了解单细胞测序基本概念及原理
2、了解单细胞测序分析的常用软件
3、掌握单细胞测序数据的下载方法
4、掌握单细胞测序数据的研究思路
5、学会R语言基本语法和绘图技巧
6、学会用R代码进行单细胞转录组分析并作图
7、熟悉CNS杂志单细胞转录组文章思路
8、熟悉零成本的单细胞相关课题设计思路
9、获得全套全自动化分析单细胞数据的流程脚本
10、单细胞测序基金申请思路、准备内容及注意事项等。
【授课专家】
来自中科院，长期从事单细胞多组学方面的项目研究，发表Nature等杂志四十多篇论文，目前承担国家科技部、国家自然基金委和重点研发计划等多项课题。
【主办单位】
玮瑜科研平台（上海玮瑜生物科技有限公司）
【承办单位】
上海玮瑜生物科技有限公司
上海焦务科技服务中心
【会议时间】
2021年5月29-30日
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会议日程
（最终日程以会议现场为准）
【课程设置】
第一天上午 7:00- 10:30 | 单细胞测序技术与应用 | 1. 单细胞组学技术发展历程和原理介绍 2. 单细胞测序技术在科研领域的应用 3. 近年单细胞技术CNS文章思路解析 4. 单细胞文章常见图表解读 5. 单细胞组学技术在癌症、发育、免疫及在植物等领域的研究内容及思路 | 理论 |
第一天下午 1:30- 5:00 | Linux及R语言入门与实操 | 1. 常规基础Linux命令入门讲解及实操训练 2. R语言简介及安装，RStudio的安装及使用说明。 3. R语言语法介绍及常用命令 4. 数据处理功能及统计应用 5. R语言画图实操：tSNE，小提琴图，热图，网络图，GO、KEGG富集图，GSEA等图形绘制 | 实操 |
第一天晚上 6:00- 9:30 | 单细胞转录组数据分析思路及流程 | 1. 单细胞高分文章分析思路解析（细胞类群确定、拟时间分析、差异表达、通路富集、转录因子、配体受体互作等） 2. 单细胞转录组比对、定量、分群及拟时间分析等软件及参数 3. 单细胞转录组转录因子、功能通路及配体受体互作思路解析 4. 单细胞组学分析常用数据库介绍及使用。 5. 基因富集分析和可视化 | 理论 |
第二天上午 7:00- 10:30 | 单细胞数据可视化、细胞分型及marker鉴定 | 1. 10X官方单细胞软件Cellranger讲解及实操 2. 从基因表达矩阵开始到marker基因筛选全过程讲解及实操 3. 通过Seurat软件进行PCA及tSNE降维 4. 单细胞转录组细胞鉴定及聚类分析 5. 通过Seurat及GSVA等进行单细胞转录组差异分析 | 实操 |
第二天下午 1:30- 5:00 | 单细胞数据轨迹分析，功能富集 单细胞基金写作 | 1. 通过Monocle软件进行单细胞转录组拟时间分析 2. 通过DAVID及metascape网站进行通路富集分析 3. 单细胞数据分析总结 4. 归纳总结零成本单细胞数据挖掘思路 5. 单细胞测序基金申请思路 6. 单细胞测序基金申请前期准备 7. 单细胞测序基金申报常见问题分析与应对 8. 如何撰写单细胞基金课题申请书 | 理论+ 实操 |
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会议嘉宾
参会指南
会议门票
【注册费用】
3200元/人。可开会务、注册、检测、分析服务等发票两班连报6000元/人（可与其他任何班一起报名）
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酒店与住宿:
为防止极端情况下活动延期或取消，建议“异地客户”与活动家客服确认参会信息后，再安排出行与住宿。
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