表观遗传学数据挖掘与分析研讨会日程

日期

时间

大纲

详细内容

周六上午（理论）

9:00-10:30

DNA甲基化调控机制、科研应用及研究思路（一）

1.明确DNA甲基化的作用机制及调控机理。

2.了解DNA甲基化在疾病等各研究领域中的应用。

3.了解DNA甲基化与转录组等多组学整合分析思路。

10:30-10:45

茶歇

10:45-12:00

DNA甲基化调控机制、科研应用及研究思路（二）

4.通过高分文章对DNA甲基化研究思路进行解读。

5.掌握DNA甲基化研究的多种技术方法。

6.了解常用DNA甲基化及疾病挖掘数据库。

12:00-13:30

午餐及午休

周六下午（实操）

13:30-15:30

DNA甲基化芯片及测序数据分析（一）

1.DNA甲基化芯片及测序分析常用软件介绍。

2.DNA甲基化芯片及测序数据分析策略。

3.DNA甲基化芯片及测序分析图表解读。

4.差异甲基化鉴定、注释及富集分析。

15:30-15:45

15:45-17:00

DNA甲基化芯片及测序数据分析（二）

5.DNA甲基化芯片数据分析（ChAMP等软件）。

6.DNA甲基化测序数据分析（bismark，methylKit等软件）

7.DNA甲基化与转录组数据整合分析。

8.利用公共甲基化数据完成整套甲基化分析流程。

17:00-18:00

晚餐及休息

晚上（理论）

18:00-21:00

RNA甲基化功能机制、研究策略及思路分析

1.RNA甲基化研究进展概述。

2.了解RNA甲基化的概念和修饰类型。

3.明确RNA甲基化对RNA加工代谢及生物学功能的调控机制。

4.了解RNA甲基化在疾病等领域中的研究应用。

5.通过高分文献思路示例及总结对RNA甲基化调控肿瘤等功能研究思路进行解析。

6.了解RNA甲基化常用的各种测序技术。

7.m⁶A甲基化的研究现状、思路和研究方法。

周日上午（实操）

8:45-10:30

m⁶A甲基化数据分析（一）

1.了解各种RNA甲基化修饰谱分析技术。

2.m⁶A测序技术流程介绍及测序报告解读。

3.m⁶A常见分析内容及相关软件介绍。

4.m⁶A peak鉴定(R包exomePeak、MACS2)、peak差异分析(R包exomePeak)、motif分析（Homer、MEME）及peak分布（RMBase）等。

10:30-10:45

茶歇

10:45-12:00

m⁶A甲基化数据分析（二）

5.m⁶A修饰基因的功能富集分析（DAVID，Metascape、GSEA等）。

6.预测m⁶A甲基化位点在线工具介绍。

7.m⁶A常用数据库介绍及使用（MeT-DB，m6AVar，RMBase）。

12:00-13:30

午餐及午休

周日下午（理论+实操）

13:30-15:30

m⁶A甲基化多组学整合分析，

1.m⁶A甲基化测序的项目延伸及思路拓展。

2.m⁶A甲基化与多组学数据（RNA-seq，Ribo-seq等）整合分析。

3.非编码RNA（miRNA及lncRNA等）的m⁶A甲基化分析。

4.通过TGGA、ICGC等数据库挖掘RNA甲基化癌症研究思路。

15:30-15:45

茶歇

15:45-17:00

课题设计与基金申请

1.RNA甲基化研究策略与课题设计。

2.RNA甲基化研究经验交流。

3.RNA甲基化相关国自然课题的介绍。

4.DNA及RNA甲基化基金申请思路、准备内容及方案设计注意事项等。

5.讨论及个性化问题答疑。

备注：必须携带电脑，上课软件会现场拷给学员，讲师会带领大家一起安装