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2019DNA甲基化与表观遗传学数据挖掘与分析学习班（10月上海班）
时间：2019-10-26 09:00 至 2019-10-27 18:00
地点：上海
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2019DNA甲基化与表观遗传学数据挖掘与分析学习班（10月上海班） 已过期会议时间：2019-10-26 09:00至 2019-10-27 18:00结束 会议规模：50人 主办单位： 玮瑜科研平台（上海玮瑜生物科技有限公司）
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会议通知
会议内容 主办方介绍
2019DNA甲基化与表观遗传学数据挖掘与分析学习班（10月上海班）宣传图
两天一夜高强度训练，理论与实战相结合
赠送高清视频供学员复习使用
2019年10月26-27日 25日报到，上海
【课程背景】
表观遗传学调控多种生命活动及疾病发生发展，已成为近年来生命科学领域的研究热点，促使了生物学多领域研究的突破性进展。随着实验和测序技术的进步，当前产生了海量的表观基因组数据，从这些数据中挖掘生物学特征对理解生命的生理及病理过程有重要意义。面对海量的数据包括DNA甲基化谱、组蛋白修饰谱、染色体开放信息等，研究人员开发了针对不同数据的分析工具和策略，理解和掌握表观基因组数据的分析方法，有助于从事表观基因组研究领域的科研工作者深入挖掘疾病、发育和衰老等重要过程的调控机制，并为进一步开展实验和临床应用研究提供潜在靶标。应广大单位和科研院所要求，我们特开设本班，为广大研究者提供科研助力。
【学习目标】
1、明确表观遗传学的研究内容和调控机制。
2、理解表观遗传学文章的图表和内在思路。
3、掌握DNA 5mC芯片和测序数据的分析流程。
4、掌握组蛋白修饰数据的分析内容和流程。
5、掌握ATAC-seq数据的分析内容和分析流程。
6、掌握非编码RNA测序数据的分析内容和流程。
7、熟悉表观遗传及疾病研究的在线工具和数据库。
8、熟悉零成本的表观遗传学相关课题设计思路。
9、获得全套全自动化分析多种表观遗传学数据的流程脚本。
【授课方式】
1、理论结合实操；
2、案例讲解分析结合；
3、协助分析学员的实际数据
【主办单位】
玮瑜科研平台（上海玮瑜生物科技有限公司）
【承办单位】
上海玮瑜生物科技有限公司
【时间地点】
时间：2019年10月26-27日 周六 周日
上海地点：田林宾馆 上海市徐汇区田林路1号
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会议日程
（最终日程以会议现场为准）
第一天上午 8:30-11:30 | 1. 了解表观遗传学的研究内容及调控机制。 2. 通过近期Cell文章理解表观遗传学文章图表和思路。 3. 了解高通量测序技术的原理和数据形式。 4. 了解表观遗传学各组学的测序技术及分析内容。 5. DNA甲基化作用机制及研究应用。 | 理论 | |
第一天下午 1:30-17:00 | Linux及R语言实操，DNA甲基化数据分析 | 1. 常用Linux命令入门讲解及实操训练。 2. R语言简介及安装，RStudio的安装及使用。 3. R语言语法介绍及常用命令。 4. 数据处理功能及统计应用。 5. DNA甲基化测序数据分析（bismark，methylKit等软件）。 6. DNA甲基化芯片数据分析（IMA等软件）。 | 实操 |
第一天晚上 18:00-21:00 | 组蛋白修饰、ATAC、表观转录组测序技术、分析思路及流程 | 1. 组蛋白修饰和ATAC的研究方法及技术发展。 2. 组蛋白修饰和ATAC的研究内容及科研思路。 3. 组蛋白修饰及ATAC数据的分析流程及绘图。 4. 组蛋白和多组学数据的整合分析。 5. 表观转录组学研究内容及多组学整合思路。 | 理论 |
第二天上午 8:30-11:30 | 组蛋白修饰、ATAC数据分析， 组学常用数据库使用 | 1. 利用fastqc、cutadapt及Trimmomatic对原始数据进行质控。 2. 通过bowtie2、bwa等软件进行基因组mapping。 3. 通过MACS2软件进行peak calling。 4. 利用HOMER软件进行peak注释及motif分析。 5. 调用R语言包Diffbind进行差异peaks分析。 6. 常用表观组学及疾病挖掘数据库介绍及使用 | 实操 |
第二天下午 1:30-17:00 | mRNA及非编码RNA分析及图形绘制 | 1. 转录组数据分析内容及研究思路。 2. 长非编码RNA、microRNA及circRNA的研究方法及思路。 3. 转录组多组学整合分析思路和案例介绍。 4. 通过tophat2、hisat2软件进行转录组数据mapping。 5. 通过HTSeq及featureCounts进行基因表达定量。 6. 通过Deseq2，edgeR等R语言包进行差异表达分析。 7. 应用DAVID及metascape网站进行通路富集分析。 8. 箱型图，热图，网络图，GO、KEGG富集图，GSEA等图形绘制。 9. 归纳总结零成本表观组学数据挖掘思路。 10. 表观遗传基金申请思路、准备内容及注意事项等。 | 理论+实操 |
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会议嘉宾
（最终出席嘉宾以会议现场为准）
【授课专家】
来自中科院，长期从事表观遗传学多组学方面的项目研究，发表Nature等杂志四十多篇论文。目前承担国家科技部、国家自然基金委和重点研发计划等多项课题。
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参会指南
会议门票 场馆介绍
【注册费用】
3400元/人。授课期间发放纸质邀请函（盖章）和发票。按交费先后顺序确定座位号。会务期间提供午餐，晚餐自理。
【住宿说明】
学员也可以自行预定或会务组代订房间
田林宾馆单间或标间为380-450元/间 现场根据实际情况安排
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上海田林宾馆隶属上海市人民政府机关事务管理局，是一所综合服务设施较为完备的三星级宾馆，坐落在沪西幽雅静谧的田林新村，毗邻上海高技术工业区和徐家汇商业中心。交通便利，乘166,732,830,712,93,946,89,120路公交车均可到达，新建的地铁9号线
温馨提示
酒店与住宿:
为防止极端情况下活动延期或取消，建议“异地客户”与活动家客服确认参会信息后，再安排出行与住宿。
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