如何快速筛选新型肿瘤标志物分子(线上培训班)
时间:2020-05-23 08:00 至 2020-06-13 18:00
地点:线上活动
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如何快速筛选新型肿瘤标志物分子(线上培训班) 已过期会议时间:2020-05-23 08:00至 2020-06-13 18:00结束 会议地点: 线上活动 详细地址会前通知 会议规模:60人 主办单位: 中国抗癌协会肿瘤标志专业委员会
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会议通知
会议内容 主办方介绍
如何快速筛选新型肿瘤标志物分子(线上培训班)宣传图
面向肿瘤标志物挖掘的大数据生信分析技术培训|生信体系课·第一期
随着测序技术的发展和海量数据的涌现,大数据分析已经成为科研工作中不可或缺的技术手段,如何基于生物信息学的方法和工具筛选新型肿瘤标志物分子,助力科研成果的发表,肿瘤测序及大数据分析专家委员会将组织生物信息学教学和科研一线的教师和博士生团队开展线上远程生信培训。期望能帮助从事生物医学研究(基础医学、临床医学、生命科学)的同行们,将各自的科研工作与生物信息学技术密切的结合,拓展新的科研思路和开辟新的科研模式。
本期课程,带你玩转肿瘤公共数据库,学会用R语言绘制可视图,设计肿瘤标志物相关课题,名额有限,请感兴趣的老师们尽快报名参与。
授课对象:
各级医院的临床医生、博/硕研究生、科研单位的研究人员以及想学习生物信息学的科研工作者。
培训特色:
■ 授课专家:
肿瘤测序及大数据分析专家委员会主办
■ 辅导助教:
长期从事生物信息学教学或研究的老师及博士生
■ 课程内容:
采用模块化+应用实例,主要包括数据库模块、分析工具模块。
■ 授课方式:
小班授课,直播辅导+操作演示+1对1远程实操指导相结合。可重复上课一次,确保学会操作。
注意事项:
■ 自备笔记本电脑
■ 确保培训期间网络稳定
■ 先报名先安排上课,本期报满为止
■ 课前指导安装上课所需软件,发送预习资料
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中国抗癌协会肿瘤标志专业委员会是中国抗癌协会所属的二级学会,由全国各大专院校、研究所、医院及企业从事肿瘤标志物基础研究及临床推广应用的专家学者组成。2016年11月26日换届选举产生第六届领导机构,第四军医大学邢金良教授担任主任委员,河北医科大学第四医院单保恩教授、中山大学附属肿瘤医院曾木圣教授、沈阳军区总医院谢晓冬教授、解放军81医院汪栋教授担任副主任委员,南京市第一医院王书奎教授等24名专家为常务委员。学会秉承“创新模式、整合资源、发展共赢”理念,为广大临床科研及企事业单位提供沟通合作的平台。
会议日程 (最终日程以会议现场为准)
课程设置:
面向肿瘤标志物挖掘的大数据分析实操培训 | |||||
第一天:数据库模块 | |||||
日期 | 时间 | 题目 | 课程内容 | ||
上午 | 8:30-9:30 | 生物信息学在肿瘤标志物挖掘中的应用 | 利用高通量数据分析的经典案例 | ||
公司的测序数据解读、中标标书解读 | |||||
9:30-9:45 | 休息 | ||||
9:45-11:45 | 肿瘤学研究中常用数据库(一) | 如何使用数据库资源来筛选肿瘤发生发展、转移、耐药、预后等相关标志物 | |||
11:45-13:30 | 休息及交流互动 | ||||
下午 | 13:30-15:30 | 肿瘤学研究中常用数据库(二) | GEO数据库介绍、数据上传和下载; TCGA数据库介绍、数据的下载, TCGA中不同组学数据的合并;ICGC数据库的使用;Cosmic数据库介绍、数据分析等 | ||
15:30-15:45 | 休息 | ||||
15:45-17:45 | 肿瘤学研究中常用数据库(三) | DAVID介绍及使用,功能注释、富集分析(GO、pathway、KEGG)及作图 | |||
第二天:分析工具模块 | |||||
日期 | 时间 | 题目 | 课程内容 | ||
上 午 | 8:30-10:30 | 肿瘤高通量数据中筛选肿瘤标志物的分析(理论+上机)(一)差异分析及功能分析 | 基于R语言以TCGA数据分析为例——突变分析、基因表达差异分析(编码及非编码基因)、DNA甲基化分析等。 R包:clusterprofiler 网页工具:enrichr | ||
10:30-10:45 | 休息 | ||||
10:45-12:15 | 肿瘤高通量数据中筛选肿瘤标志物的分析(理论+上机)(二)差异基因的可视化 | R语言作图(小提琴图、热图等), ggplot2绘图及统计分析;相关性分析;聚类分析、主成分分析 | |||
12:15-13:30 | 休息及交流互动 | ||||
下 午 | 13:30-15:30 | 肿瘤高通量数据中筛选肿瘤标志物的分析(理论+上机)(三)肿瘤标志物的生存分析 | 详细讲解一篇以LncRNA测序数据为对象,挖掘肿瘤标志物的生物信息学分析过程,重点介绍单因素、多因素、生存分析的过程。 | ||
15:30-15:45 | 休息 | ||||
15:45-17:45 | 肿瘤高通量数据中筛选肿瘤标志物的分析(理论+上机)(四)肿瘤标志物筛选的临床实验研究 | 肿瘤学系统性综述和Meta分析的过程:针对临床随机对照实验、队列研究、病例对照研究、生存研究资料;讲解Revman软件使用 |
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会议嘉宾
参会指南
会议门票
特别注意
培训使用软件:
ZOOM
培训费用:
2800元/人,肿瘤标志专业委员会会员优惠200元,五人团购2000元/人
培训时间:
人满开班,每班不超过30人,周六-周日2天,四档时间可选
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温馨提示
酒店与住宿:
为防止极端情况下活动延期或取消,建议“异地客户”与活动家客服确认参会信息后,再安排出行与住宿。
退款规则:
活动各项资源需提前采购,购票后不支持退款,可以换人参加。
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