2019非编码RNA数据挖掘速成班(10月南宁)
时间:2019-10-26 08:00 至 2019-10-27 18:00
地点:南宁
- 参会报名
- 会议介绍
- 会议日程
- 会议嘉宾
- 参会指南
2019非编码RNA数据挖掘速成班(10月南宁) 已过期会议时间:2019-10-26 08:00至 2019-10-27 18:00结束 会议地点: 南宁 详细地址会前通知 会议规模:暂无 主办单位: 小张聊科研
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会议介绍
会议内容 主办方介绍
2019非编码RNA数据挖掘速成班(10月南宁)宣传图
5年前如果你不做mRNA表达谱你就out了,10年前如果你不做miRNA表达谱你就out了,5年前如果你不研究lncRNA表达谱你就out了,最近几年如果你没听说过circRNA你就落伍了。ceRNA又是何物,各种RNA的相互作用网络如何构建?
审时度势,与时俱进,本次培训将带你了解这些研究热点,这些非编码RNA如何产生,如何行使生物学功能,如何相互作用构成生物网络,我们将为你一一道来。
他山之石可以攻玉
同行是如何研究这些热点的,哪些方法可以为我所用。我们将和你分享一些成功案例,梳理研(fa)究(wen)思(tao)路(lu)。
纸上得来终觉浅,绝知此事要躬行
看着人家发文章似乎很容易,自己做起来却无从下手。本次培训将手把手教你如何从RNAseq数据(mRNA, lncRNA, miRNA)得到差异表达基因,基因功能富集,生存分析,ceRNA网络构建。教你画出火山图,柱状图,聚类图,热图,气泡图,KM生存曲线,ceRNA网络图。
课程亮点
1、展示不做实验纯生信挖掘的paper,阐述非编码RNA发文套路;
2、讲解从mRNA, lncRNA, miRNA数据筛选差异表达基因的方法,直通关键分子;
3、传授非编码RNA靶点的预测方法,构建网络机制;
4、介绍miRNA,circRNA,lncRNA各种数据库、实用工具及其使用方法,充实科研武器库;
5、TCGA数据库提供创新性附加代码,可适用于各种表型分组比较(如肿瘤分期、性别);
6、对代码进行精心改造,可以用于综合性数据库GEO;
6、高效速成,代码“傻瓜式”自动化运行,课后自己修改少量参数便可直接上手,比如这个:
不仅如此,课后,我们还会给大家设置一个配套的线上课程,作为线下课程的补充和拓展。线上课程详细介绍了多种非编码RNA数据库的使用以及如何利用这些数据库构建ceRNA网络,每一节都是干货满满。
适合人群
广大临床/科研工作者,研究生,有无生信基础均可参加,有R语言基础者更佳。
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小张聊科研于2019年10月26日举办2019非编码RNA数据挖掘速成班(10月南宁)。
会议日程 (最终日程以会议现场为准)
课程表
Day1 |
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8:00-9:00 |
报道,领取资料 |
9:00-12:00 |
背景知识介绍 |
miRNA,circRNA,lncRNA的产生,作用机制,功能 |
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miRNA,circRNA,lncRNA相关数据库及工具介绍,使用及数据下载 |
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ceRNA案例分享 (包括mRNA-miRNA-lncRNA网络和mRNA-miRNA-circRNA网络) |
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12:00-13:00 |
午休 |
13:00-17:00 |
R语言简介 |
R语言概述 |
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R软件及R包安装 |
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R语言语法及数据类型 |
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条件语句 |
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循环 |
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函数 |
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17:00-17:30 |
学员提问及讨论 |
Day 2 |
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9:00-12:00 |
利用TCGA数据构建ceRNA网络(实操,基于R) |
TCGA简介及数据下载 |
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寻找差异表达基因 |
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火山图,热图,聚类图,柱状图 |
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差异表达基因GO,KEGG富集分析,气泡图,柱状图,KEGG通路图展示,GO富集环状图 |
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mRNA,lncRNA表达相关性分析,点状图 |
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mRNA, lncRNA, miRNA网络构建,cytoscape展示,hub基因筛选,ceRNA网络桑基图 |
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12:00-13:00 |
午休 |
13:00-17:00 |
利用GEO数据构建ceRNA网络(实操,基于R) |
GEO简介及数据下载 |
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寻找差异表达基因 |
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火山图,热图,聚类图,柱状图 |
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差异表达基因GO,KEGG富集分析,气泡图,柱状图,KEGG通路图展示,GO富集环状图 |
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mRNA,lncRNA表达相关性分析,点状图 |
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mRNA, lncRNA, miRNA网络构建,cytoscape展示,hub基因筛选,ceRNA网络桑基图 |
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17:00-17:30 |
学员提问及讨论
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注:
1、实际授课过程中,老师可能根据学员学习速度对课程进行微调。
2、请学员自带电脑,请使用windows系统(请勿使用XP系统,推荐win10)或者mac系统,老师用win10系统进行讲解;电脑配置推荐8G及以上内存,否则部分软件运行可能会卡;想做个生信小能手,8G内存是标配!
3、为了提高学习效率,本次课程会提前发给学员从数据库中下载数据的视频教程,同时也会提供下载好的数据以及相关代码,方便学员提前进行预习。
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会议嘉宾 (最终出席嘉宾以会议现场为准)
主讲人
李老师,生物信息学博士,有八年的测序数据分析经验。博士期间参与多个课题项目,涉及机器学习,芯片数据分析,核酸及蛋白序列分析,全基因组甲基化测序数据分析,全转录组测序数据分析,miRNA及靶基因分析,癌症相关基因预测及预后分析等,发表SCI论文32篇,其中一作及并列一作15篇。
工作期间积累了丰富的DNA,甲基化,RNA捕获测序,Amplicon捕获测序实验流程和数据分析经验。具有ctDNA数据分析经验,对变异数据进行注释, 指导临床用药。自行搭建Linux集群,开发测序数据全自动分析平台。
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参会指南
会议门票
报名费:
10月18日前 | 10月19日至25日 | 现场报名缴费 |
3200 | 3400 | 3700 |
两人组团报名,每人可优惠100元
三人组团报名,每人可优惠200元
四人及以上组团报名,每人可优惠300元
注:
1、报名费包含一份上面提到的非编码RNA网课,主要介绍非编码RNA常用数据库的使用以及如何构建ceRNA网络,将在课后的那一周开始为大家设置。
2、本次学习班提供两天的午餐,其余食宿费用自理,本次培训班按报名顺序排座位号,建议尽早报名。
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温馨提示
酒店与住宿:
为防止极端情况下活动延期或取消,建议“异地客户”与活动家客服确认参会信息后,再安排出行与住宿。
退款规则:
活动各项资源需提前采购,购票后不支持退款,可以换人参加。
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会议支持:
-
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