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首页 > 商务会议 > 医疗医学会议 > 2019非编码RNA数据挖掘速成班(10月南宁) 更新时间:2019-09-27T11:39:40

2019非编码RNA数据挖掘速成班(10月南宁)
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2019非编码RNA数据挖掘速成班(10月南宁) 已过期

会议时间:2019-10-26 08:00至 2019-10-27 18:00结束

会议地点: 南宁  详细地址会前通知  

会议规模:暂无

主办单位: 小张聊科研

发票类型:增值税普通发票 增值税专用发票

行业热销热门关注看了又看 换一换

        会议介绍

        会议内容 主办方介绍


        2019非编码RNA数据挖掘速成班(10月南宁)

        2019非编码RNA数据挖掘速成班(10月南宁)宣传图

        5年前如果你不做mRNA表达谱你就out了,10年前如果你不做miRNA表达谱你就out了,5年前如果你不研究lncRNA表达谱你就out了,最近几年如果你没听说过circRNA你就落伍了。ceRNA又是何物,各种RNA的相互作用网络如何构建?

        审时度势,与时俱进,本次培训将带你了解这些研究热点,这些非编码RNA如何产生,如何行使生物学功能,如何相互作用构成生物网络,我们将为你一一道来。


        他山之石可以攻玉

        同行是如何研究这些热点的,哪些方法可以为我所用。我们将和你分享一些成功案例,梳理研(fa)究(wen)思(tao)路(lu)。


        纸上得来终觉浅,绝知此事要躬行

        看着人家发文章似乎很容易,自己做起来却无从下手。本次培训将手把手教你如何从RNAseq数据(mRNA, lncRNA, miRNA)得到差异表达基因,基因功能富集,生存分析,ceRNA网络构建。教你画出火山图,柱状图,聚类图,热图,气泡图,KM生存曲线,ceRNA网络图。

        课程亮点

        1、展示不做实验纯生信挖掘的paper,阐述非编码RNA发文套路;

        2、讲解从mRNA, lncRNA, miRNA数据筛选差异表达基因的方法,直通关键分子;

        3、传授非编码RNA靶点的预测方法,构建网络机制;

        4、介绍miRNA,circRNA,lncRNA各种数据库、实用工具及其使用方法,充实科研武器库;

        5、TCGA数据库提供创新性附加代码,可适用于各种表型分组比较(如肿瘤分期、性别);

        6、对代码进行精心改造,可以用于综合性数据库GEO;

        6、高效速成,代码“傻瓜式”自动化运行,课后自己修改少量参数便可直接上手,比如这个:

        2019非编码RNA数据挖掘速成班(10月南宁)

        2019非编码RNA数据挖掘速成班(10月南宁)

        2019非编码RNA数据挖掘速成班(10月南宁)

        2019非编码RNA数据挖掘速成班(10月南宁)

        不仅如此课后,我们还会给大家设置一个配套的线上课程,作为线下课程的补充和拓展。线上课程详细介绍了多种非编码RNA数据库的使用以及如何利用这些数据库构建ceRNA网络,每一节都是干货满满

        适合人群

        广大临床/科研工作者,研究生,有无生信基础均可参加,有R语言基础者更佳。

        查看更多

        小张聊科研

        小张聊科研于2019年10月26日举办2019非编码RNA数据挖掘速成班(10月南宁)。

        会议日程

        (最终日程以会议现场为准)


        课程表

        Day1

        8:00-9:00

        报道,领取资料

        9:00-12:00

        背景知识介绍

        miRNA,circRNA,lncRNA的产生,作用机制,功能

        miRNA,circRNA,lncRNA相关数据库及工具介绍,使用及数据下载

        ceRNA案例分享 (包括mRNA-miRNA-lncRNA网络和mRNA-miRNA-circRNA网络)

        12:00-13:00

        午休

        13:00-17:00

        R语言简介

        R语言概述

        R软件及R包安装

        R语言语法及数据类型

        条件语句

        循环

        函数

        17:00-17:30

        学员提问及讨论

        Day 2

        9:00-12:00

        利用TCGA数据构建ceRNA网络(实操,基于R)

        TCGA简介及数据下载

        寻找差异表达基因

        火山图,热图,聚类图,柱状图

        差异表达基因GO,KEGG富集分析,气泡图,柱状图,KEGG通路图展示,GO富集环状图

        mRNA,lncRNA表达相关性分析,点状图

        mRNA, lncRNA,  miRNA网络构建,cytoscape展示,hub基因筛选,ceRNA网络桑基图

        12:00-13:00

        午休

        13:00-17:00

        利用GEO数据构建ceRNA网络(实操,基于R)

        GEO简介及数据下载

        寻找差异表达基因

        火山图,热图,聚类图,柱状图

        差异表达基因GO,KEGG富集分析,气泡图,柱状图,KEGG通路图展示,GO富集环状图

        mRNA,lncRNA表达相关性分析,点状图

        mRNA, lncRNA,  miRNA网络构建,cytoscape展示,hub基因筛选,ceRNA网络桑基图

        17:00-17:30

        学员提问及讨论

         

         

        注:

        1、实际授课过程中,老师可能根据学员学习速度对课程进行微调。

        2、请学员自带电脑,请使用windows系统(请勿使用XP系统,推荐win10)或者mac系统,老师用win10系统进行讲解;电脑配置推荐8G及以上内存,否则部分软件运行可能会卡;想做个生信小能手,8G内存是标配!

        3、为了提高学习效率,本次课程会提前发给学员从数据库中下载数据的视频教程,同时也会提供下载好的数据以及相关代码,方便学员提前进行预习。

        查看更多

        会议嘉宾

        (最终出席嘉宾以会议现场为准)


        主讲人

        李老师,生物信息学博士,有八年的测序数据分析经验。博士期间参与多个课题项目,涉及机器学习,芯片数据分析,核酸及蛋白序列分析,全基因组甲基化测序数据分析,全转录组测序数据分析,miRNA及靶基因分析,癌症相关基因预测及预后分析等,发表SCI论文32篇,其中一作及并列一作15篇。

        工作期间积累了丰富的DNA,甲基化,RNA捕获测序,Amplicon捕获测序实验流程和数据分析经验。具有ctDNA数据分析经验,对变异数据进行注释, 指导临床用药。自行搭建Linux集群,开发测序数据全自动分析平台。

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        参会指南

        会议门票


        报名费:

        10月18日前

        10月19日至25日

        现场报名缴费

        3200

        3400

        3700

        两人组团报名,每人可优惠100元

        三人组团报名,每人可优惠200元

        四人及以上组团报名,每人可优惠300元

        注:

        1、报名费包含一份上面提到的非编码RNA网课,主要介绍非编码RNA常用数据库的使用以及如何构建ceRNA网络,将在课后的那一周开始为大家设置。

        2、本次学习班提供两天的午餐,其余食宿费用自理,本次培训班按报名顺序排座位号,建议尽早报名。

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        温馨提示
        酒店与住宿: 为防止极端情况下活动延期或取消,建议“异地客户”与活动家客服确认参会信息后,再安排出行与住宿。
        退款规则: 活动各项资源需提前采购,购票后不支持退款,可以换人参加。

        会议支持:

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          具体折扣标准请参见plus会员页面
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          仅PC站支持。
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        部分参会单位

        主办方没有公开参会单位

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