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中国科学院系统生物学重点实验室成立于2006年。实验室依托：中国科学院上海生命科学研究院。 系统生物学是21世纪生命科学的一门新兴学科，也是在经典实验生物学、生物大科学、系统科学和计算数学等基础上形成的一门交叉科学。系统生物学一方面包括了经典实验生物学和各种"组学"研究平台，另一方面还需要计算科学、数学等理论科学方面的理论和工具。系统生物学的主要研究目标是复杂的生命活动如细胞信号转导和个体发育，以及危害人类健康的复杂性疾病，如肿瘤、糖尿病和神经退行性疾病。
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