TCGA&GEO生信高通量数据挖掘分析研讨会2019(11月哈尔滨班)
时间:2019-11-30 08:00 至 2019-12-01 18:00
地点:哈尔滨
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TCGA&GEO生信高通量数据挖掘分析研讨会2019(11月哈尔滨班) 已过期会议时间:2019-11-30 08:00至 2019-12-01 18:00结束 会议地点: 哈尔滨 详细地址会前通知 会议规模:暂无 主办单位: 上海遐永医药科技 医药加科研培训中心 上海遐锦生物科技有限公司
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会议介绍
会议内容 主办方介绍
TCGA&GEO生信高通量数据挖掘分析研讨会2019(11月哈尔滨班)宣传图
TCGA&GEO生信高通量数据挖掘分析研讨会
培训简介:
癌症是临床医学中非常重要的疾病方向。TCGA数据库中包含了常见了40种癌症方向(含30000个样本)的高通量数据及临床信息。大家对TCGA数据库的使用近几年也在逐渐增加!如图1所示。
图1 : pubmed数据库检索的包含“TCGA”发表的SCI 文章数量(2018.11.07)
关键靶标分析是指基于生信的方法从高通量数据中挖掘到与研究方向最相关的靶标基因(mRNA,miRNA,lncRNA或蛋白)。
因此,需要我们自己掌握高通量数据挖掘的能力以及逻辑性的生信分析思路,从海量信息中获得自己想要的关键基因!
培训预期:
1. 通过两整天培训,掌握TCGA,GEO数据库的使用、下载及高通量数据分析思路和实用操作知识点。
2. 可以独立完成一篇基于公共数据库的高通量数据挖掘分析。
3. 课后赠送1小时全场串联视频,用于学员复习。
4. 赠送一份最近5年的高价值国自然标书(医药加高价值标书库里面选择)
5. 讲师团队赠送TCGA数据库甲基化、基因表达谱整合分析报告和疾病mRNA+lncRNA分析报告
主办方:医药加平台
承办方:上海遐永医药科技有限公司
会议时间:2019年11月30日-12 月 01 日
上课时间:上午9:00-12:00,下午1:30-5:00
会议地点:哈尔滨医科大学附属肿瘤医院 放疗楼 放疗示教室
哈尔滨市南岗区哈平路150号
通过本次学习,您可以学会以下作图
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南京巴傲得生物科技有限公司(Biogottechnology,co,Ltd),是专一服务于生命科学研究的专业技术型企业。是一大批志同道合的资深专业人士共同创办的具有现代化经营管理水平的生物高科技企业,从事生物技术产品的开发及销售,致力于将巴傲得生物打造成中国乃至世界一流的生物技术产品供应商。巴傲得生物长期备有Bioworld抗体现货4000多种抗体可以在一周左右送到客户的手里。精湛品质、合理价格、专业服务,是我们为您服务的宗旨。在细胞信号通路、免疫学、蛋白组学上拥有显著优势,其抗体产品、生长因子等为生命科学科研工作者提供了极大的便利。
医药加科研培训中心举办了2018肠道菌群与代谢组学国自然课题设计及研究策略专题会议(12月北京班) 2019临床预测模型构建与基于R语言统计分析学习班(01.05-01.06北京班) 2019全国循证医学Meta分析及网状Meta三天精讲学习班(1月北京班) 第10期测序与芯片高通量数据挖掘与分析学习班2019(1月上海班) 2019肠道菌群与代谢组学国自然课题设计及研究策略专题会议(1月上海班) 2019国自然基金标书构思与撰写学习班(1月上海班) TCGA,GEO生信高通量数据挖掘专题学习班2019(1月上海班) 第8期医学SCI论文写作及发表技巧学习班2019(1月上海班) ......
上海遐锦生物科技有限公司上海遐锦生物科技有限公司于2019年11月29日举办全国循证医学Meta分析与网状Meta研讨会2019(11月上海班)会议。
会议日程 (最终日程以会议现场为准)
详细课程安排见课表
TCGA&GEO高通量数据挖掘分析班课表 | |||
日期 | 时间 | 课程安排 | 内容介绍 |
周六上午 | 9:00-10:00 | 生信简介 | 生物信息介绍 |
高通量:测序及芯片介绍——多组学:转录组学、基因组学、表观组学、宏基因组学等 | |||
经典生信SCI文章的思路解读,了解TCGA数据库、GEO数据库及高通量测序数据的挖掘获得创新结论并发文章的思路 | |||
10:00-10:15 | 茶歇 | ||
10:15-12:00 | TCGA数据库 NCBI GEO数据库 | TCGA数据库:最全的癌症高通量数据公共库(简介) | |
TCGA数据库的产生过程 | |||
TCGA官方数据库的介绍和使用(包含了转录组、基因组、表观组和临床信息数据) | |||
GEO数据库介绍及使用:高通量芯片数据查找、筛选、探针转换、差异分析等。 | |||
12:00-13:30 | 午餐及午休 | ||
周六下午 | 13:30-15:00 | TCGA相关下载工具 | TCGA数据库据下载:RNA-seq数据、miRNA-seq数据、甲基化数据、基因组数据及临床信息数据的下载 |
15:00-15:20 | 茶歇 | ||
15:20-17:00 | TCGA相关分析工具 | TCGA数据分析——突变分析、差异分析、关联分析、生存分析、miRNA调控靶基因分析等。 | |
获得生存曲线图(KM曲线,分为临床因素和基因表达两种KM曲线) | |||
周日上午 | 8:30-10:30 | TCGA数据后续高级分析工具实战 | 功能富集分析——GO富集和KEGG pathway富集分析 |
聚类热图制作 | |||
10:30-10:45 | 茶歇 | ||
10:45-12:00 | TCGA数据后续高级分析工具实战 | 蛋白互作分析(PPI)及网络图构建 | |
网络分析及hub蛋白/基因获得。 | |||
12:00-13:30 | 午餐及午休 | ||
周日下午 | 13:30-15:00 | TCGA数据库与GEO数据库挖掘 | 基于TCGA的lncRNA-miRNA-mRNA全转录组整合分析思路演练 基于TCGA的甲基化与转录组整合分析思路演练 基于GEO数据库多套数据整合(meta)分析思路演练 |
15:00-15:20 | |||
15:20-16:30 | 整体演练并录屏 | 在电脑上快速完成从头到尾的一套数据实战,及答疑 | |
注意事项:学员需自己带电脑,要求为windows系统,现场不得录音录像,上课所用软件为Heml和GSEA |
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会议嘉宾 (最终出席嘉宾以会议现场为准)
讲师简介:宋伟博士
成果:参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。
研究方向:有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。
培训经历:在上海、北京、广州、沈阳、南京等城市举办过几十场培训班。
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参会指南
会议门票
收费标准:会务费:2800元每位(会务费包含电子版教材、午餐,住宿费自理。)
优惠政策:
1.提前确认报名及转账的,可以提前拿到学习材料
2.三人组团报名,每人优惠100元
3.四人组团报名,每人优惠200元,
4.五人组团报名缴费,额外带一人免费注册!
可以开正规会务发票,纸质邀请函(盖红章)。
推荐上海好望角饭店
注意事项:必须携带win7以上系统的电脑,现场不得录音录像。提前安装好Heml和GSEA软件(可提前向主办方索要安装包)
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温馨提示
酒店与住宿:
为防止极端情况下活动延期或取消,建议“异地客户”与活动家客服确认参会信息后,再安排出行与住宿。
退款规则:
活动各项资源需提前采购,购票后不支持退款,可以换人参加。
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