科研作图班课程安排

日期

时间

内容安排

第一天上午

8:00-9:00

软件安装Origin, ImageJ,Adobe Illustrator,UCSF Chimera。

9:05-10:00

Origin数据导入，如何根据任何方程导入新数据，根据行与列进行统计分析，如每一列的均值、方差、均值方差等。

10:05-11:00

Origin内数据的线性和非线性拟合，药物靶点结合竞争与非竞争性分析。根据任何已知方程对实验数据的模拟，柱状图和线型图制作及error bar画法。图与原始数据的对应。

11:05-12:00

Origin数据图格式修改、颜色修改、数据区间修改、横坐标线性到指数修改、坐标轴大小设置、标记修改。

12:00-13:30

统一午餐

第一天下午

13:30-14:30

Adobe illustrator画图优势、画板概念、层（layer）概念、添加及删除画板和层、画板和层大小设置、画板内的分格。

14:35-15:30

Selection和direct selection工具差别及使用、标准形状物体的画法、标准形状通过pathfinder整合成多样不规则形状物体、颜色样品板swatches设置、eyedropper工具使用、pencil与pen工具使用、颜色梯度使用。

15:35-17:00

Origin图表如何导入illustrator、图表在illustrator内的修改对齐、坐标轴粗细调整、标记重拍对齐、图表层内对齐、代表论文内的制图训练；细胞信号转导通路模式图和实验路线图制作。

17:00-18:00

基金标书与高分文章用的分子机理模式图的制作

第二天上午

8:30-9:30

ImageJ界面介绍、识别格式，图像和小电影的保存，图像对比度调整、图像序列堆叠与解堆叠、堆叠图像到montage转换、去除和提取图像序列或者小电影中特定的一帧或者几帧图像、图像crop、图像区间选取及强度面积计算、凝胶电影条带强度计算。

9:35-10:30

荧光显微镜照片标尺scale bar放置及大小设置、图像平滑处理及背景去除、plungin的安装使用、time series的分析、图像内任意切线的强度分布图。

10:35-12:00

ImageJ plugin的介绍及java编写imageJ plugin简单介绍、循环操作如何生成batch script（群操作脚本语言）。

12：00-13：30

统一午餐

第二天下午

13:30-14:30

蛋白结构解析方法介绍及如何用UCSF chemira显示蛋白结构、pdf文件格式及内容介绍、结构图像导出。

14:35-15:30

基金标书与高分文章用的分子机理模式图的制作巩固提高，蛋白结构图像导出到illustrator、铅笔工具trace蛋白结构卡通图、结构旋转与对应图。

15:35-17:00

图像单颗粒示踪分析，扩散常数计算、illustrator制作会议展板的展示、学术文章作图练习。

PS:务必携带电脑，要求windows系统。MAC请提前做好双系统或自己装好上课软件

软件安装Origin, ImageJ,Adobe Illustrator,UCSF Chimera